More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0781 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  100 
 
 		 439 aa  884    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  74.04 
 
 		 428 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  73.8 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  71.53 
 
 		 418 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  65.46 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  64.63 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  62.32 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  61.86 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  61.12 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  59.48 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  57.41 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  59.9 
 
 		 419 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  62.13 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  60.15 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  59.31 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  58.37 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  59.46 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  53.83 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  52.44 
 
 		 434 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  52.09 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  52.77 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  53.12 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  53.09 
 
 		 437 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  53.45 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  53.45 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  51.58 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  50.61 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  55.15 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  51.48 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  51.24 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  51.36 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  39.11 
 
 		 404 aa  299  7e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  36.29 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  36.03 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  36.29 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  35.51 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  35.6 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.31 
 
 		 405 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.77 
 
 		 414 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  35.92 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.92 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  38.82 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.33 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  33.58 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.25 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.37 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  36.5 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  35.68 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  34.2 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  34.78 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.74 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.25 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.91 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.73 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.67 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  32.55 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.5 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.63 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  30.32 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  34.35 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  30.99 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  38.97 
 
 		 346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  37.88 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  29.79 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.5 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  31.02 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.18 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.81 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  35.73 
 
 		 397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.11 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  33.89 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  34.43 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  34.43 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.49 
 
 		 331 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.62 
 
 		 351 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  33.93 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.53 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  32.97 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  34.17 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.94 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  34.94 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  34.94 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  34.94 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  38.46 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  30.62 
 
 		 354 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  34.64 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  39.46 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.03 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.64 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  31.75 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  38.62 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  34.94 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  35.08 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  35.63 
 
 		 353 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.55 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.74 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  36.89 
 
 		 355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.49 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  34.34 
 
 		 352 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>