More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4205 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  82.9 
 
 
428 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  77.05 
 
 
429 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  100 
 
 
419 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  76.17 
 
 
416 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  75.68 
 
 
416 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  69.1 
 
 
413 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  68.56 
 
 
418 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  67.15 
 
 
429 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  65.77 
 
 
424 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  62.14 
 
 
421 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  66.1 
 
 
420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  62.01 
 
 
425 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  61.58 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  61.31 
 
 
428 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  58.37 
 
 
418 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  59.9 
 
 
439 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  56.03 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  61.31 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  58.27 
 
 
441 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  57.04 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  56.05 
 
 
434 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  56.61 
 
 
414 aa  455  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  56.4 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  55.19 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  55.19 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  55.31 
 
 
437 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  56.44 
 
 
411 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  52.45 
 
 
412 aa  431  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  53.71 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  51.83 
 
 
424 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  47 
 
 
404 aa  351  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  49.38 
 
 
426 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  35.86 
 
 
404 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.56 
 
 
414 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  35.61 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  35.86 
 
 
403 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  35.45 
 
 
421 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  35.35 
 
 
404 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.67 
 
 
404 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  37.21 
 
 
405 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  36.15 
 
 
401 aa  222  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.43 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.34 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.36 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.63 
 
 
427 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.95 
 
 
402 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.83 
 
 
399 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.19 
 
 
423 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.82 
 
 
419 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  34.65 
 
 
441 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  36.41 
 
 
459 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.16 
 
 
416 aa  202  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.17 
 
 
396 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  33.58 
 
 
419 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  34.78 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.37 
 
 
402 aa  193  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  31.04 
 
 
403 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  38.18 
 
 
346 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  37.27 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.15 
 
 
391 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  29.16 
 
 
403 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.12 
 
 
405 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  35.05 
 
 
352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.02 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  30.49 
 
 
422 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.04 
 
 
397 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  32.95 
 
 
346 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  35.24 
 
 
357 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.59 
 
 
408 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.09 
 
 
432 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  30.07 
 
 
402 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  37.39 
 
 
345 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.5 
 
 
403 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  34.35 
 
 
351 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  34.03 
 
 
545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.75 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  32.04 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.62 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.62 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  35.24 
 
 
352 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.23 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.58 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.07 
 
 
396 aa  166  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.61 
 
 
348 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.71 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  34.94 
 
 
352 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  29.58 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.08 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  34.64 
 
 
352 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.91 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.53 
 
 
348 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.43 
 
 
388 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  32.96 
 
 
368 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  33.06 
 
 
368 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>