More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0806 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  100 
 
 
408 aa  824    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  74.88 
 
 
412 aa  630  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  65.92 
 
 
454 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  64.25 
 
 
434 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  63.52 
 
 
430 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  64.09 
 
 
437 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  63.16 
 
 
441 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  63.52 
 
 
432 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  63.52 
 
 
432 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  63.73 
 
 
437 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  58.1 
 
 
414 aa  488  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  55.06 
 
 
425 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  57.8 
 
 
411 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  55.31 
 
 
425 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  55.45 
 
 
424 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  53.69 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  53.71 
 
 
419 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  53.35 
 
 
418 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  52.84 
 
 
416 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  55.3 
 
 
420 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  53.1 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  51.72 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  53.73 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  51.73 
 
 
428 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  52.58 
 
 
421 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  51.48 
 
 
439 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  52.33 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  51.23 
 
 
416 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  51.25 
 
 
426 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  50.25 
 
 
424 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  52.61 
 
 
428 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  48.4 
 
 
404 aa  373  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  44.3 
 
 
404 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  43.5 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  43.5 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  42.12 
 
 
421 aa  302  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  42.97 
 
 
404 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  41.67 
 
 
404 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  40.83 
 
 
414 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  39.85 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  37.31 
 
 
401 aa  263  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  38.22 
 
 
419 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  37.22 
 
 
399 aa  253  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  36.76 
 
 
416 aa  246  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.92 
 
 
401 aa  242  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  35.5 
 
 
402 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35 
 
 
401 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  32.82 
 
 
403 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  33.67 
 
 
402 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.73 
 
 
402 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  39.71 
 
 
356 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  38.87 
 
 
351 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  39.13 
 
 
348 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  40.54 
 
 
352 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  33.76 
 
 
441 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  41.27 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  40.96 
 
 
352 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.82 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  40.18 
 
 
354 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  40.96 
 
 
352 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  38.29 
 
 
345 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.48 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  37.71 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  40.66 
 
 
352 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  30.15 
 
 
422 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  37.71 
 
 
348 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.46 
 
 
396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  40.54 
 
 
353 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  40.54 
 
 
353 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  40.06 
 
 
352 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  33.86 
 
 
422 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  35.37 
 
 
408 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  32.84 
 
 
433 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.5 
 
 
396 aa  193  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  39.76 
 
 
352 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  42.15 
 
 
351 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  38.14 
 
 
354 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.51 
 
 
419 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  36.69 
 
 
346 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  37.04 
 
 
354 aa  190  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  38.22 
 
 
352 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  37.86 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  35.03 
 
 
349 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.2 
 
 
427 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  39.2 
 
 
353 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  38.08 
 
 
403 aa  186  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  37.13 
 
 
367 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.12 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  36.96 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  38.04 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.94 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  37.46 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  38.25 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  36.36 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  38.15 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>