More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0176 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  89.18 
 
 		 425 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  100 
 
 		 425 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  68.22 
 
 		 418 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  65.46 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  67 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  66.43 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  66.75 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  64.29 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  63.06 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  66.18 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  65 
 
 		 421 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  62.47 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  65.5 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  63.46 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  62.01 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  64.36 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  61.23 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  55.72 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  57.36 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  57.36 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  55.4 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  54.99 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  56.82 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  54.5 
 
 		 437 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  58.85 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  56.47 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  59.56 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  55.06 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  53.1 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  55.3 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  52.44 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  42.04 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  39.84 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  39.31 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  39.05 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  36.91 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  35.62 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  35.31 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  36.45 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.46 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.25 
 
 		 421 aa  237  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.56 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.32 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.66 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  36.7 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  34.9 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  35.04 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.89 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  36.48 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.98 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.7 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  35.07 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  34.31 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.75 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  32.98 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.19 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  31.84 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  34.17 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  40.48 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  36.55 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  34.03 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  39.57 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.99 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  36.68 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  36.68 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  36.08 
 
 		 351 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  35.67 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  29.38 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  35.42 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.43 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  38.73 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  34.45 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.62 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  35.33 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  28.23 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  36.5 
 
 		 348 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  38.65 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  37.2 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  34.19 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  38.41 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.34 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  37.5 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  37.76 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.16 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  36.45 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  37 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  34.82 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  35.12 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  38.44 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  34.83 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  33.12 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  34.52 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.52 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  34.36 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  35.11 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  35.32 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.84 
 
 		 349 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  37.5 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  35.85 
 
 		 354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.52 
 
 		 352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>