More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0058 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  100 
 
 		 404 aa  806    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  51.04 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  49.48 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  46.51 
 
 		 403 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  49.48 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  49.74 
 
 		 413 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  49.62 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  41.97 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.82 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.94 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  37.27 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  34.39 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.77 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  34.39 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  36.95 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  36.1 
 
 		 401 aa  222  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  33.93 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.6 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.33 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.6 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  35.51 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  38.08 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  34.72 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.73 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  37.31 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  34.55 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  35.77 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  32.15 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.84 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.42 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  32.22 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  36.24 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  32.9 
 
 		 430 aa  199  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  32.73 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.9 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  34.13 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.65 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.65 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  33.76 
 
 		 437 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.16 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  35.7 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  34.86 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.96 
 
 		 434 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  31.73 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  35.08 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  34.76 
 
 		 428 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  34.54 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  32.98 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  34.02 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.78 
 
 		 459 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  34.48 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  37.47 
 
 		 424 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.25 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.83 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  30.59 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  34.56 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  37.04 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  32.68 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.78 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.7 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  36.64 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 545 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.93 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  33.75 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  33.17 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  31.59 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  36.27 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  32.47 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  33.16 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  32.28 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  32.84 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.09 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.92 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.78 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  35.74 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.04 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.12 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  36.2 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  34.94 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  36.02 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  35.44 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.34 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  34.34 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.26 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.34 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  34.34 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  34.04 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.04 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  32.64 
 
 		 354 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  34.04 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.43 
 
 		 353 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.43 
 
 		 353 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.84 
 
 		 349 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  34.34 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  33.73 
 
 		 352 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  33.73 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  33.73 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.75 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  35.26 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  34.04 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>