More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1549 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  100 
 
 
404 aa  835    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  47.47 
 
 
414 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  47.24 
 
 
437 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  45.84 
 
 
434 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  45.25 
 
 
454 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  49.35 
 
 
412 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  45.43 
 
 
430 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  45.9 
 
 
441 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  48.4 
 
 
408 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  44.75 
 
 
432 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  44.75 
 
 
432 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  44.25 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  47 
 
 
419 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  47.26 
 
 
428 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  45.92 
 
 
411 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  44.86 
 
 
429 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  45.69 
 
 
416 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  46.09 
 
 
424 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  43.68 
 
 
421 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  45.57 
 
 
416 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  44.53 
 
 
413 aa  329  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  43.28 
 
 
426 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  42.14 
 
 
418 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  42.04 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  40.62 
 
 
418 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  41.83 
 
 
424 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  39.9 
 
 
428 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  40.1 
 
 
404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  42.45 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  39.11 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.86 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  44.01 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  39.65 
 
 
404 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  40.15 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  38.89 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  38.86 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  42.74 
 
 
420 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  37.31 
 
 
405 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  37.97 
 
 
401 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  37.06 
 
 
399 aa  259  7e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  36.34 
 
 
402 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  36.71 
 
 
414 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  35.98 
 
 
401 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  36.27 
 
 
421 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.98 
 
 
401 aa  247  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.96 
 
 
419 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.67 
 
 
416 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  33.07 
 
 
403 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  37.61 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.91 
 
 
403 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33 
 
 
408 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  37.68 
 
 
351 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.92 
 
 
427 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.16 
 
 
419 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.84 
 
 
422 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  37.61 
 
 
348 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  34.16 
 
 
354 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.85 
 
 
423 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  32.9 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.33 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  35.99 
 
 
354 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  35.34 
 
 
346 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  35.61 
 
 
351 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.51 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  35.13 
 
 
348 aa  196  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  36.64 
 
 
353 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  35.78 
 
 
349 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  36.64 
 
 
353 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  34.72 
 
 
352 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  33.17 
 
 
459 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  34.84 
 
 
348 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  37.79 
 
 
353 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  33.62 
 
 
346 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  34.37 
 
 
402 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  35.69 
 
 
368 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.58 
 
 
351 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  37.73 
 
 
352 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  32.38 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  34.54 
 
 
377 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  37.12 
 
 
368 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  36.45 
 
 
354 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  34.29 
 
 
394 aa  189  7e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  38.3 
 
 
363 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  38.04 
 
 
352 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  38.34 
 
 
352 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  36.46 
 
 
396 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  36.39 
 
 
345 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  36.81 
 
 
368 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  37.17 
 
 
403 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1280  threonine synthase  33.87 
 
 
380 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  35.61 
 
 
362 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  38.04 
 
 
352 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  37.12 
 
 
352 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  37.42 
 
 
352 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  37.12 
 
 
352 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  31.79 
 
 
402 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  34.08 
 
 
374 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  37.42 
 
 
352 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  37.12 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  29.34 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>