More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4034 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  100 
 
 
396 aa  813    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  49.35 
 
 
403 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  45.95 
 
 
403 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  49.21 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  48.03 
 
 
408 aa  338  8e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  44.44 
 
 
405 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  49.62 
 
 
404 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  38.07 
 
 
441 aa  246  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.25 
 
 
415 aa  242  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  34.35 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  35.06 
 
 
405 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  35.96 
 
 
404 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.31 
 
 
401 aa  226  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.58 
 
 
401 aa  222  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  36.11 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  35.96 
 
 
424 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  34.38 
 
 
428 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.54 
 
 
401 aa  219  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  31.22 
 
 
408 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.77 
 
 
404 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.77 
 
 
399 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  34.04 
 
 
403 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  33.85 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  34.18 
 
 
421 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  34.55 
 
 
416 aa  215  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  37.14 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  34.23 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  33.17 
 
 
419 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  33.25 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.78 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  32.98 
 
 
425 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.78 
 
 
412 aa  212  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  33.16 
 
 
441 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  34.56 
 
 
425 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  34.54 
 
 
414 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  31.79 
 
 
454 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  33.94 
 
 
428 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  37.01 
 
 
427 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  33.16 
 
 
429 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  31.44 
 
 
437 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  35.7 
 
 
413 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.55 
 
 
422 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.54 
 
 
432 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.54 
 
 
432 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  35.92 
 
 
421 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  32.38 
 
 
404 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  31.2 
 
 
430 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  32.55 
 
 
439 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.73 
 
 
434 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.22 
 
 
391 aa  203  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  38.64 
 
 
459 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.82 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  34.11 
 
 
429 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  33.25 
 
 
428 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  32.88 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  36.05 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  32.9 
 
 
418 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.25 
 
 
419 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.63 
 
 
397 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.95 
 
 
419 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.6 
 
 
394 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.67 
 
 
426 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  36.1 
 
 
403 aa  186  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  33.7 
 
 
420 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  32.3 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  35.26 
 
 
402 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  31.39 
 
 
408 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  34.42 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.44 
 
 
375 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.5 
 
 
406 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.88 
 
 
331 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.11 
 
 
396 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  35.56 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  35.74 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  35.62 
 
 
359 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  35.4 
 
 
360 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  31.37 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  34.49 
 
 
356 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.76 
 
 
353 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.76 
 
 
353 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  35.49 
 
 
366 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  31.91 
 
 
402 aa  159  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.71 
 
 
408 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  34.05 
 
 
377 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  34.14 
 
 
348 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  33.43 
 
 
360 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.17 
 
 
381 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  33.43 
 
 
360 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  33.43 
 
 
360 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.02 
 
 
311 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  32.94 
 
 
356 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  31.08 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  31.79 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.35 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  33.74 
 
 
361 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.16 
 
 
420 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.63 
 
 
349 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  32.73 
 
 
354 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  33.04 
 
 
352 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  34.27 
 
 
352 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>