More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0942 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 408 aa  807    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  51.83 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  49.15 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.78 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2884  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.22 
 
 		 372 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  35.81 
 
 		 404 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  34.71 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  35.26 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  34.16 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2793  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.67 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  34.16 
 
 		 404 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.27 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  33.61 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.06 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  36.39 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  34.9 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.33 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.84 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.03 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.71 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  37.65 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.68 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  35.22 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  36.41 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.42 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  33.91 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.1 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.41 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  37.1 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  35.91 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  36.07 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  33.7 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  33.59 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  33.82 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  31.87 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  33.16 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  33.16 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.99 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  32.54 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.96 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  32.35 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.81 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  33.15 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  31.62 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  36.09 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  35.91 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  33.97 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  33.06 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  36.75 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.62 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  32.8 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  37.09 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.84 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  31.97 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.42 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  33.17 
 
 		 421 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  33.89 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  30.52 
 
 		 441 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  34.24 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  32.23 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  33.02 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  33.59 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  36.16 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  36.31 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  34.16 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  34.16 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.82 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  32.51 
 
 		 414 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  32.93 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  35.99 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  35.99 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  36.31 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  29.59 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  33.13 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  35.42 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  29.41 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  31.68 
 
 		 371 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  34.86 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  33.06 
 
 		 429 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  35.22 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  30.28 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.52 
 
 		 349 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  33.06 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  31.68 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  31.68 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  34.08 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  36.68 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  34.18 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  32.81 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  36.34 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  31.68 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  35.69 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  33.54 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  31.85 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  33.84 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  33.84 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  31.85 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  32.34 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  33.53 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  30.91 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>