255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2884 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2884  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
372 aa  730    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  45.61 
 
 
441 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  47.86 
 
 
397 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2793  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.1 
 
 
391 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150891  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.74 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.82 
 
 
408 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  30 
 
 
405 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  31.25 
 
 
401 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  28.53 
 
 
404 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  31.05 
 
 
401 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  28.53 
 
 
404 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  29.46 
 
 
399 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  28.53 
 
 
403 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.22 
 
 
405 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.91 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  28.21 
 
 
404 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.51 
 
 
403 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.73 
 
 
403 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.49 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.42 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  27.43 
 
 
402 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  28.34 
 
 
416 aa  139  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  27.12 
 
 
404 aa  139  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  31.82 
 
 
419 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  30.94 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.38 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.48 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.13 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  31.29 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  33.77 
 
 
428 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  35.31 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  28.66 
 
 
391 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  31.18 
 
 
425 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.53 
 
 
404 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  27.76 
 
 
419 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  30.21 
 
 
396 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  31.83 
 
 
459 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  30.5 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  31.61 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.78 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.77 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.93 
 
 
406 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  29.17 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  31.12 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  25.21 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  29.62 
 
 
428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  27.58 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  26.94 
 
 
412 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  31.96 
 
 
424 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.79 
 
 
421 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  32.06 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  31.5 
 
 
416 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  31.21 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  31.61 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  30.75 
 
 
433 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  28.53 
 
 
394 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  26.67 
 
 
430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  29.49 
 
 
371 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.21 
 
 
419 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  28.92 
 
 
424 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  29.41 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  26.52 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  30.12 
 
 
362 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  26.94 
 
 
422 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  32.52 
 
 
351 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  30.16 
 
 
413 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.01 
 
 
432 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  26.35 
 
 
454 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  31.23 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  35.28 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  30.96 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  32.54 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  30.66 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  27.68 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.65 
 
 
418 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  31.72 
 
 
331 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  29.35 
 
 
349 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  29.03 
 
 
346 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.5 
 
 
351 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  29.12 
 
 
368 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  36.07 
 
 
351 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  29.93 
 
 
348 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  34.29 
 
 
354 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  30.28 
 
 
348 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  32.42 
 
 
360 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  29.48 
 
 
416 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  29.59 
 
 
348 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  29.77 
 
 
368 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  27.01 
 
 
437 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  31.23 
 
 
402 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  31.69 
 
 
375 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  27.06 
 
 
351 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  29.34 
 
 
363 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  24.44 
 
 
437 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  30.53 
 
 
426 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  28.17 
 
 
368 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  32.57 
 
 
347 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  26.69 
 
 
441 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  31.65 
 
 
420 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  34.39 
 
 
361 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>