More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4458 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  100 
 
 		 413 aa  852    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  59.56 
 
 		 408 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  51.83 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  49.75 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  50.39 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  49.21 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  49.74 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  38.14 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  34.22 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  33.69 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.63 
 
 		 404 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  32.89 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.63 
 
 		 403 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.95 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  36.41 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.28 
 
 		 415 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  35.09 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.47 
 
 		 405 aa  205  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.18 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  34.56 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.83 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.34 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.42 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  31.05 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  36.64 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  29.77 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  29.77 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.59 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.01 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  32.47 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  29.2 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30.08 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  29.52 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  27.32 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  28.8 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.38 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  27.7 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.02 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  30.05 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  31.95 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  30.03 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.74 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.39 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  30.08 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  30.89 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  31.81 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  30.89 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  30.65 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  31.69 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  29.35 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.74 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  29.73 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.58 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.38 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.56 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  33.14 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  32.12 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  30.64 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.74 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  33.23 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.94 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  30.51 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  29.5 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.23 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.54 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.59 
 
 		 408 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  30.7 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  34.95 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.62 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.53 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  29.49 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  33.24 
 
 		 373 aa  152  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.89 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  29.92 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.95 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.04 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  29.81 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  31.93 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  33.64 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  34.04 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  32.11 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  32.53 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  31.9 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  29.4 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  31.34 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  31.29 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  34.04 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  33.74 
 
 		 348 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  28.95 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  33.43 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.13 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  32.76 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  34.34 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  32.84 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  34.83 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  32.23 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  32.23 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  30.12 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  32.23 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>