More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6417 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 382 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  43.77 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  42.74 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.17 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.59 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.63 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.46 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.93 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.7 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.14 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.75 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.02 
 
 		 359 aa  209  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  35.8 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.23 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.95 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.79 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  32.9 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.68 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.42 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  32.82 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  36.9 
 
 		 414 aa  186  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.25 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.04 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.54 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.89 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.15 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  31.18 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.48 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  36.83 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  34.46 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  34.77 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.33 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.51 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  37.13 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  32.55 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  35.44 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.42 
 
 		 359 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  31.25 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.86 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  32.12 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.91 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.81 
 
 		 434 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  39.19 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  32.84 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.84 
 
 		 432 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.84 
 
 		 432 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  32.9 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.71 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.71 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  31.32 
 
 		 441 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  30.71 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.56 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.05 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  32.39 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30.49 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  30.61 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  29.66 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.42 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.65 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  34.12 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  31.7 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.86 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  29.84 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  33.33 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  35.09 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  37.63 
 
 		 347 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.04 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.42 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.69 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  36.71 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  33.51 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  29.43 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.41 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  32.38 
 
 		 429 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  32.02 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  32.68 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  28.23 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  34.55 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  32.82 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  31.34 
 
 		 428 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  33.84 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  32.06 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  32.38 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.27 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  33.74 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  38.91 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  37.8 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  37.98 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  31.28 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  38.51 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  32.65 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  32.88 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  35.96 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  36.55 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  35.8 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  34.82 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  37.22 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  37.22 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  38.32 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>