More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1259 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
356 aa  703    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.25 
 
 
358 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.62 
 
 
359 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.22 
 
 
371 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.38 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.22 
 
 
330 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.39 
 
 
375 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  35.59 
 
 
360 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 
379 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.36 
 
 
381 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.83 
 
 
392 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 
382 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  35.77 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  36.34 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  31.63 
 
 
361 aa  179  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  37.67 
 
 
403 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.38 
 
 
376 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.05 
 
 
343 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.93 
 
 
357 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.64 
 
 
359 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  36.27 
 
 
414 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.53 
 
 
403 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  32 
 
 
404 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  34.95 
 
 
408 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  34.14 
 
 
405 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  33.42 
 
 
414 aa  159  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  31.89 
 
 
408 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.46 
 
 
437 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  31.2 
 
 
404 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  31.27 
 
 
454 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.71 
 
 
422 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  31.18 
 
 
430 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  30.73 
 
 
441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.47 
 
 
432 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.47 
 
 
432 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.95 
 
 
401 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  34.61 
 
 
433 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.72 
 
 
391 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.46 
 
 
434 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  32.25 
 
 
405 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.32 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.86 
 
 
401 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  33.69 
 
 
403 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  30.05 
 
 
404 aa  152  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  30.65 
 
 
437 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.78 
 
 
419 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.06 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.56 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  32.17 
 
 
423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  30.32 
 
 
421 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  32.89 
 
 
401 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  31.71 
 
 
425 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  29.46 
 
 
412 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  29.81 
 
 
416 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.75 
 
 
459 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  31.2 
 
 
411 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.13 
 
 
394 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  33.87 
 
 
419 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.13 
 
 
425 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.01 
 
 
408 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.55 
 
 
427 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.71 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  29.79 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  35.05 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  29.76 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  30.29 
 
 
439 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  31.12 
 
 
428 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  35.35 
 
 
396 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  32.35 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  27.97 
 
 
404 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  33.52 
 
 
406 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  30.65 
 
 
441 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  33.22 
 
 
331 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  28.73 
 
 
429 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.41 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.23 
 
 
415 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  30.65 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  35.31 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  28.68 
 
 
416 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  34.05 
 
 
426 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  29.38 
 
 
416 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  30.36 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  31.15 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  31.51 
 
 
351 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  33.55 
 
 
345 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  32.88 
 
 
397 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  28.66 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.27 
 
 
353 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.27 
 
 
353 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  31.83 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  32.9 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  31.1 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7498  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.64 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.29 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  31.21 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  33.33 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  30.67 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  32.91 
 
 
348 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  33.75 
 
 
368 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>