More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4873 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
359 aa  733    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.75 
 
 
371 aa  438  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.96 
 
 
386 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.62 
 
 
356 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.54 
 
 
358 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.67 
 
 
392 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  35.14 
 
 
360 aa  203  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.74 
 
 
375 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.82 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  33.97 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  33.97 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.02 
 
 
382 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.69 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.19 
 
 
343 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.79 
 
 
381 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.71 
 
 
379 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  34.69 
 
 
375 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 
376 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.06 
 
 
359 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.17 
 
 
403 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.35 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  31.64 
 
 
404 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.37 
 
 
404 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.15 
 
 
391 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  33.42 
 
 
422 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  31.37 
 
 
404 aa  167  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.78 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  31.55 
 
 
405 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.29 
 
 
414 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  29.82 
 
 
441 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.5 
 
 
430 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.79 
 
 
408 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  32.8 
 
 
401 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.81 
 
 
419 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.12 
 
 
459 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  32.63 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  30.79 
 
 
432 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  30.79 
 
 
432 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.33 
 
 
401 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.88 
 
 
394 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  29.31 
 
 
421 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.71 
 
 
399 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  30.79 
 
 
414 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  31.68 
 
 
402 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  28.46 
 
 
437 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  29.89 
 
 
454 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.07 
 
 
434 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  31.41 
 
 
433 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  30.89 
 
 
427 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  29.7 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.52 
 
 
396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  29.79 
 
 
422 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.57 
 
 
437 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  31.17 
 
 
441 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.36 
 
 
405 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  30.55 
 
 
428 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.77 
 
 
403 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  28.87 
 
 
418 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  28.94 
 
 
439 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  33.42 
 
 
406 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  28.84 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.19 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.65 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.61 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  30.93 
 
 
402 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  32.07 
 
 
403 aa  135  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  29.77 
 
 
428 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  30.93 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  33.44 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  29.1 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  28.38 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.85 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  25.33 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  29.63 
 
 
428 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  27.78 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  30.82 
 
 
416 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  30.69 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  31.66 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  34.7 
 
 
346 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  28.31 
 
 
412 aa  126  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  31.86 
 
 
351 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  31.83 
 
 
424 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  29.84 
 
 
429 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.8 
 
 
426 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  33.85 
 
 
358 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.45 
 
 
396 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.75 
 
 
346 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  30.63 
 
 
425 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.21 
 
 
349 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  28.08 
 
 
354 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  31.96 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  31.96 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  33.33 
 
 
357 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  32.79 
 
 
368 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  30.72 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  35.05 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  33.23 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  30.91 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  27.44 
 
 
418 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  32.42 
 
 
347 aa  116  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>