More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4648 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 376 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  70.92 
 
 		 392 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.2 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  53.35 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.29 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.91 
 
 		 379 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  38.57 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  39.51 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.66 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.61 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.94 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.38 
 
 		 356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.04 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.92 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.62 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  36.54 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.42 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.69 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  31.37 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.36 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.12 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  30.83 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.38 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  36.12 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  30.73 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.89 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.92 
 
 		 439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.74 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  37.87 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  30.59 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.81 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  28.27 
 
 		 432 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  28.27 
 
 		 432 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.59 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  36.66 
 
 		 427 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  31.74 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  34.15 
 
 		 396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  30.99 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.05 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  36.89 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.07 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  30.29 
 
 		 428 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  32.11 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.54 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.41 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.74 
 
 		 401 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  32.94 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  32.46 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  32.23 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.09 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  32.21 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  29.43 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  29.91 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  27.49 
 
 		 437 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.05 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.33 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.61 
 
 		 331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  32.94 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.58 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  28.57 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  31.46 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  35.91 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  30.86 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.17 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.52 
 
 		 421 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.53 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  33.94 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  37.27 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  29.83 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.73 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  31.82 
 
 		 425 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  35.56 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  30.96 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  35.01 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  30.18 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  31.75 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  33.33 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  32.96 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  35.19 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.88 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  32.02 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.29 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  31.58 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  35.26 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  28.83 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.42 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  34.37 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  28.74 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  35.89 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  34.37 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  32 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  34.46 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  33.74 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.18 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  30 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  35.71 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  31.69 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.33 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  25.97 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>