More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1541 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
379 aa  754    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.22 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.5 
 
 
381 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  54.57 
 
 
375 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.72 
 
 
392 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.91 
 
 
376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.17 
 
 
382 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  38.4 
 
 
360 aa  235  9e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  35.77 
 
 
361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.9 
 
 
330 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.71 
 
 
359 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.98 
 
 
371 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.69 
 
 
357 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.34 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.37 
 
 
386 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  35.4 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.31 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.47 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  33.6 
 
 
414 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  35.22 
 
 
334 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  31.2 
 
 
404 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.05 
 
 
432 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.05 
 
 
432 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.49 
 
 
418 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.07 
 
 
439 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.15 
 
 
405 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  31 
 
 
418 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  32.38 
 
 
429 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  32.06 
 
 
413 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  33.96 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.81 
 
 
404 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.16 
 
 
406 aa  155  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  31.81 
 
 
404 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  31.38 
 
 
428 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  33.51 
 
 
399 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.5 
 
 
437 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  32.58 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  31.54 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  31.25 
 
 
404 aa  152  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.95 
 
 
425 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  31.64 
 
 
424 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.28 
 
 
331 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.51 
 
 
401 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  30.85 
 
 
441 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  29.73 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  30.45 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.13 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  32.52 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  32.97 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  32.18 
 
 
429 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  31.13 
 
 
416 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.47 
 
 
434 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.77 
 
 
430 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  30.51 
 
 
420 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  29.29 
 
 
454 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  31.69 
 
 
402 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.84 
 
 
403 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  31.04 
 
 
416 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  32.35 
 
 
401 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  29.17 
 
 
373 aa  143  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  34.78 
 
 
426 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.81 
 
 
421 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  31.11 
 
 
428 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  30.81 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.58 
 
 
388 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  32.13 
 
 
414 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.64 
 
 
396 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.18 
 
 
405 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  32.55 
 
 
413 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  30.16 
 
 
412 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.07 
 
 
415 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.06 
 
 
403 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.27 
 
 
408 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.7 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.1 
 
 
396 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  33.81 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  31.85 
 
 
411 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.58 
 
 
394 aa  133  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  32.93 
 
 
347 aa  133  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.25 
 
 
419 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  33.13 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  29.78 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  31.9 
 
 
422 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  32.82 
 
 
368 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  28.35 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  31.02 
 
 
419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.24 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  35.29 
 
 
368 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  32.99 
 
 
404 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  31.38 
 
 
368 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  26.67 
 
 
416 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  35.49 
 
 
362 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.45 
 
 
351 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  30.7 
 
 
367 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  35.06 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  33.33 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.77 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.1 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>