More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3169 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
386 aa  780    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  77.58 
 
 
371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.96 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.8 
 
 
358 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.38 
 
 
356 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.76 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.61 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.56 
 
 
330 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  35.37 
 
 
334 aa  189  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  34.97 
 
 
360 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.38 
 
 
382 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  32.9 
 
 
361 aa  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.92 
 
 
376 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.29 
 
 
343 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.93 
 
 
381 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.37 
 
 
379 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  33.72 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.3 
 
 
357 aa  172  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  31.2 
 
 
404 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  31.2 
 
 
403 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.46 
 
 
404 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  30.69 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  30.24 
 
 
404 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  32.86 
 
 
405 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.47 
 
 
359 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  30.9 
 
 
414 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.77 
 
 
391 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  34.47 
 
 
422 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.75 
 
 
403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.48 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  30.71 
 
 
401 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  29.72 
 
 
408 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  29.7 
 
 
399 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28.07 
 
 
402 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.83 
 
 
405 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.04 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.85 
 
 
401 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.14 
 
 
427 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  33.14 
 
 
428 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  29.93 
 
 
414 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  26.07 
 
 
416 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  33.62 
 
 
408 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.16 
 
 
411 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  31.51 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.57 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  28.86 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  30.89 
 
 
441 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.07 
 
 
396 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  28.08 
 
 
418 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.36 
 
 
419 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  35.26 
 
 
424 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  28.92 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  28.82 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  29.77 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.6 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  28.27 
 
 
373 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  28.53 
 
 
437 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  27.14 
 
 
421 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  35.84 
 
 
426 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.71 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.19 
 
 
459 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  29.31 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  29.31 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  31.83 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.32 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  29.31 
 
 
425 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.57 
 
 
419 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  30.05 
 
 
433 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  29.68 
 
 
439 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  29.5 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  31.88 
 
 
413 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.53 
 
 
404 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  30 
 
 
428 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.75 
 
 
396 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  27.67 
 
 
441 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  29.95 
 
 
425 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  28.99 
 
 
422 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  27.67 
 
 
412 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.71 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  32.54 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  32.93 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  30.41 
 
 
368 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  30.29 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  30.41 
 
 
368 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  31.56 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  31.64 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  29 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  31.6 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  28.04 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  33.92 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  32.84 
 
 
357 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  32.27 
 
 
358 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  27.75 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  31.96 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  33.63 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  30.23 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  30.09 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  32.94 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  30.97 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  29.7 
 
 
413 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>