More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2066 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
343 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  40.22 
 
 
334 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  39.16 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  37.83 
 
 
360 aa  225  7e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.07 
 
 
382 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.19 
 
 
359 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.56 
 
 
375 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.05 
 
 
356 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36 
 
 
358 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.94 
 
 
330 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.57 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  32.32 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.13 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.69 
 
 
359 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.02 
 
 
386 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.31 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.32 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.11 
 
 
404 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.11 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  30.97 
 
 
404 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.33 
 
 
404 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.96 
 
 
357 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.02 
 
 
391 aa  159  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  30.71 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.58 
 
 
373 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  28.39 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.15 
 
 
396 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.33 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.02 
 
 
394 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.33 
 
 
406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  30.53 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  29.95 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  31.95 
 
 
403 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  31.36 
 
 
401 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  30.16 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  29.19 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  30.45 
 
 
402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.06 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  28.49 
 
 
422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.62 
 
 
331 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  26.55 
 
 
414 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  28.69 
 
 
423 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.21 
 
 
401 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  34.19 
 
 
339 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  28.53 
 
 
419 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  30.16 
 
 
402 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  30.22 
 
 
427 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  29.02 
 
 
459 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30.56 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  33.02 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  27.74 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  29.4 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  30.29 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  33.12 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  28.21 
 
 
425 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  28.27 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  33.72 
 
 
347 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  27.75 
 
 
454 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  33.12 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  31.55 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  30.14 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  31.42 
 
 
414 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  33.02 
 
 
367 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  32.2 
 
 
368 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  32.7 
 
 
367 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  34.8 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.51 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  28.2 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.51 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  32.99 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  32.52 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  32.54 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  25.51 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  29.2 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  33.33 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  31.87 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  33.23 
 
 
367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  33.21 
 
 
413 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  30.21 
 
 
396 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  32.88 
 
 
345 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.88 
 
 
411 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  31.96 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  28.17 
 
 
430 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.25 
 
 
412 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.3 
 
 
349 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  33.01 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  31.96 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  28.28 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.54 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.56 
 
 
439 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  29.85 
 
 
428 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.19 
 
 
434 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.54 
 
 
437 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  32.9 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  26.21 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  29.85 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  31.01 
 
 
348 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  31.48 
 
 
416 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.62 
 
 
421 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>