More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7498 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7498  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 395 aa  817    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4235  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.77 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0665  threonine synthase  32.67 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  32.99 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  28.57 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  29.27 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  29.27 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  27.86 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  31.11 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  30.41 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  29.02 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  29.12 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  28.98 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  28.78 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28.94 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  27.58 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  31.41 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  29.07 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  29.53 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  28.72 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  27.36 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  27.39 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  27.99 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  31.76 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  30.33 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  26.96 
 
 		 373 aa  116  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.17 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.64 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  26.92 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.03 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  28.34 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  33.75 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  28.01 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  32.51 
 
 		 346 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  27.61 
 
 		 334 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  32.59 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  30.05 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  29.39 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  26.7 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  26.92 
 
 		 414 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  31.52 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  26.05 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  28.66 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  26.42 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  28.66 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  28.98 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  31.33 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  26.79 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  29.43 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  25.63 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  28.26 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  27.24 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  33.13 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  29.69 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  26.15 
 
 		 434 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  24.94 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  27.06 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  27.27 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  30.79 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  25.31 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  27.53 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  30.63 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  30.72 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  30.63 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  31.29 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.27 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  33.23 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  33.55 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  29.88 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  31.25 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  26.04 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  26.28 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  27.72 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  26.8 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  29.01 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.21 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  29.01 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  32.27 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.94 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  34.57 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  30.63 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  34.29 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  27.2 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  32.48 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  30.77 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  34.27 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.19 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  28.96 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  26.3 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  28.85 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1241  threonine synthase  28.8 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000161931  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.65 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  28.96 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  33.33 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  27.44 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>