More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83915 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_83915  threonine deaminase  100 
 
 		 539 aa  1110    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370739  normal  0.0940196 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03830  hypothetical threonine dehydratase (Eurofung)  56.63 
 
 		 567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01420  threonine ammonia-lyase, putative  52.21 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00537189  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  51.37 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  52.83 
 
 		 507 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  51.37 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  51.08 
 
 		 511 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  51.95 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  51.24 
 
 		 549 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  54.3 
 
 		 515 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  50.68 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 527 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  54.25 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  52.9 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  50.39 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  50.49 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  49.51 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  49.32 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  49.32 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  50.68 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  51.15 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  49.06 
 
 		 606 aa  482  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  49.13 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  51.17 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  49.13 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  49.22 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  49.43 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  50.19 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  53.12 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  49.22 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  52.15 
 
 		 510 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 565 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  49.04 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  48.44 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  51.08 
 
 		 523 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  52.05 
 
 		 511 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  50.39 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  50.98 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  47.56 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  49.41 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 507 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  47.65 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  49.51 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  48.93 
 
 		 520 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  50.1 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  49.23 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  49.51 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  48.93 
 
 		 507 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  49.13 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  50.59 
 
 		 510 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  48.95 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  49.02 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  51.07 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  47.17 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  49.52 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  50.59 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  48.35 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  50 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  49.13 
 
 		 535 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  51.08 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  49.52 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  47.96 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  49.61 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  50.1 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  51.56 
 
 		 507 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  50.49 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  47.78 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  50.2 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  48.83 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  49.42 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  49.51 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  50 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  48.53 
 
 		 501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  49.71 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  48.75 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  50.2 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  48.53 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  49.22 
 
 		 565 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  49.51 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  48.36 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  49.42 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  48.43 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>