More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0589 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0589  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 325 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2444  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.69 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000936956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3516  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  44.98 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.15071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  33.01 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  31.25 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  32.71 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  31.73 
 
 		 403 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  31.73 
 
 		 403 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  31.43 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  35.8 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  32.22 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  30.36 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  30.33 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  33.55 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  31.48 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  36.02 
 
 		 537 aa  136  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  34.88 
 
 		 402 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.46 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  31.58 
 
 		 501 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  33.81 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  34.98 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  28.93 
 
 		 402 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  32.17 
 
 		 514 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  32.5 
 
 		 514 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 514 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  35.86 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  32.17 
 
 		 515 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  33.1 
 
 		 514 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  33.1 
 
 		 514 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  33.1 
 
 		 514 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  30.9 
 
 		 527 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  32.74 
 
 		 514 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  35.9 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  32.38 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  32.38 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  33.1 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  32.38 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  31.82 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  31.82 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  31.82 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  32.74 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  31.82 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  30.63 
 
 		 522 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  33.91 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  29.68 
 
 		 503 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  32.56 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  31.51 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  31.12 
 
 		 529 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  32.29 
 
 		 507 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  32.29 
 
 		 507 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  30.06 
 
 		 506 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  30.06 
 
 		 506 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  31.47 
 
 		 516 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  31.94 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  28.04 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  31.19 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  31.83 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  34.09 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  29.82 
 
 		 510 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  28.85 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  34.63 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  35.19 
 
 		 414 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  30.3 
 
 		 516 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  31.6 
 
 		 507 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  31.72 
 
 		 531 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  36.4 
 
 		 411 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  30.07 
 
 		 515 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  32.06 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  29.79 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  30.2 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  35.25 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  29.97 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  32.06 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  31.79 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  31.79 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  31.79 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  29.12 
 
 		 511 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  30.53 
 
 		 509 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  30.91 
 
 		 507 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.8 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  31.65 
 
 		 517 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  33.82 
 
 		 401 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  29.62 
 
 		 501 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  31.36 
 
 		 526 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  33.07 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  35.09 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  30.46 
 
 		 523 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  30.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  29.02 
 
 		 514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  35.52 
 
 		 403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 406 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  31.21 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  30.79 
 
 		 545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  29.91 
 
 		 520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>