226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0158 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0158  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2385  putative GAF sensor protein  68.85 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0490708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1439  putative phytochrome sensor protein  56.98 
 
 		 187 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0339  putative phytochrome sensor protein  44.75 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.482314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3737  hypothetical protein  45.11 
 
 		 244 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2891  putative phytochrome sensor protein  48.33 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0335936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1467  putative GAF sensor protein  45.3 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0208193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1857  putative GAF sensor protein  37.57 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3729  putative GAF sensor protein  35.58 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1669  putative GAF sensor protein  32.54 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 2161 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 2153 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2479  putative phytochrome sensor protein  30 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 2783 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0677  putative GAF sensor protein  30.52 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000194317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  27.06 
 
 		 1335 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  27.44 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.33 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  26.99 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.99 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.93 
 
 		 880 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.93 
 
 		 860 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2404  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  29.09 
 
 		 784 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2232  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.27 
 
 		 781 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000474033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  29.12 
 
 		 616 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1756  PTSINtr with GAF domain, PtsP  28.14 
 
 		 781 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0090097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2905  putative GAF sensor protein  30.59 
 
 		 782 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 		 719 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 726 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 1431 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1228  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.9 
 
 		 744 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0147001  hitchhiker  0.0051402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 654 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.9 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 637 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 677 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0430  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  29.59 
 
 		 759 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1133  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.9 
 
 		 744 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000186405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04410  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  29.59 
 
 		 759 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 718 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48230  Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  29.17 
 
 		 759 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.492707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  27.38 
 
 		 554 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 666 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.38 
 
 		 1332 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  25.3 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3956  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.11 
 
 		 754 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 630 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  27.53 
 
 		 505 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 3470 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1703  PTSINtr with GAF domain, PtsP  25.42 
 
 		 780 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.57578e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2516  PTSINtr with GAF domain, PtsP  25.42 
 
 		 780 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000436421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1116  hypothetical protein  24.84 
 
 		 245 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0602606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  37.5 
 
 		 648 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.83 
 
 		 356 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.19 
 
 		 494 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.25 
 
 		 657 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 857 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 659 aa  51.2  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5145  PTSINtr with GAF domain, PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.498029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5052  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 373 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 1519 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5198  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0884  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  30.43 
 
 		 755 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  26.16 
 
 		 649 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0320  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.874945  normal  0.406154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 647 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5265  cGMP-specific and -stimulated phosphodiesterase/adenylate cyclase  25.15 
 
 		 324 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1527 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4217  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 371 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 905 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.56 
 
 		 819 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 662 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2680  putative GAF sensor protein  24.18 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.181755  normal  0.469967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 634 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  27.85 
 
 		 515 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.81 
 
 		 755 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 523 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  40.32 
 
 		 688 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5377  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.38 
 
 		 759 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.839628  normal  0.0308961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  28.74 
 
 		 494 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  28.74 
 
 		 494 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 719 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 711 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 819 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  25.15 
 
 		 523 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 523 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0735  putative PAS/PAC sensor protein  23.56 
 
 		 512 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  25.15 
 
 		 523 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  34.52 
 
 		 645 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 636 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 695 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 635 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 785 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5580  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 699 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0190821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>