More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2034 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 478 aa  969    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 475 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  42.58 
 
 		 730 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.68 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 743 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.82 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 506 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  43.04 
 
 		 486 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  41.5 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  39.83 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  39.32 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.28 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 492 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 555 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 546 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  29.95 
 
 		 811 aa  127  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  26.58 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 551 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 551 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 555 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 605 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.58 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 633 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 602 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 605 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 1538 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 607 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 1538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  27.9 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 592 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  23.75 
 
 		 547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 		 514 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  22.24 
 
 		 609 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  28.12 
 
 		 1537 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.35 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  24.39 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  26.33 
 
 		 580 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 580 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  21.94 
 
 		 598 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.54 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.21 
 
 		 610 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  23.51 
 
 		 555 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.97 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 610 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 596 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.38 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.45 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  25.61 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  26.67 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  26.19 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3736  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  25.48 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  25.24 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  23.94 
 
 		 576 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 663 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.72 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  23.43 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27.44 
 
 		 6676 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.89 
 
 		 602 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  23.26 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.63 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  24.54 
 
 		 618 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  22.64 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>