More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0952 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 743 aa  1543    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 730 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.4 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.55 
 
 		 519 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  44.47 
 
 		 475 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  40.96 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  67.86 
 
 		 236 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 		 506 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  64.86 
 
 		 227 aa  307  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 		 483 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 478 aa  291  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 487 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  37.87 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 487 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  39.04 
 
 		 481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  39.56 
 
 		 495 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 498 aa  279  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 		 484 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 493 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  56.62 
 
 		 223 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  54.13 
 
 		 216 aa  250  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  53.85 
 
 		 221 aa  243  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  52 
 
 		 223 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.81 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  48.67 
 
 		 226 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  47.79 
 
 		 226 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  48.67 
 
 		 226 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  48.67 
 
 		 226 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  48.37 
 
 		 217 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  52.73 
 
 		 217 aa  220  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  45.95 
 
 		 224 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  50.46 
 
 		 231 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  47.64 
 
 		 218 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  47.2 
 
 		 229 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 492 aa  194  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  42.6 
 
 		 220 aa  183  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  41.86 
 
 		 223 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  41.74 
 
 		 222 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 493 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 507 aa  158  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  39.09 
 
 		 226 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  36.99 
 
 		 202 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 603 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 633 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 		 603 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 597 aa  129  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.72 
 
 		 580 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 580 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 605 aa  124  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 607 aa  124  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 602 aa  124  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 605 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 509 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 610 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.65 
 
 		 610 aa  119  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 		 592 aa  119  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  24.05 
 
 		 609 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 610 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 812 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  27.3 
 
 		 811 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 600 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 824 aa  114  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 602 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.35 
 
 		 598 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 854 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.1 
 
 		 603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 595 aa  112  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 622 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.71 
 
 		 937 aa  112  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 504 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 602 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 		 607 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  27.47 
 
 		 624 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 610 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 598 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.44 
 
 		 612 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 599 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  25.8 
 
 		 600 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 599 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  25.43 
 
 		 601 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  23.69 
 
 		 604 aa  108  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  23.56 
 
 		 608 aa  108  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.12 
 
 		 610 aa  108  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  22.12 
 
 		 611 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 594 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.29 
 
 		 498 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 601 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.82 
 
 		 614 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 602 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.48 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 598 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>