More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1286 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
507 aa  993    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  52.65 
 
 
492 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
475 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 
519 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 
506 aa  207  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 
507 aa  206  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  38.92 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  37.4 
 
 
486 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
484 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
493 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  36.19 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
487 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.46 
 
 
489 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 
498 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
487 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 
478 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.04 
 
 
743 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.69 
 
 
504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 
824 aa  153  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 
592 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  34.31 
 
 
811 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 
812 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
612 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
509 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
620 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
493 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 
607 aa  133  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.98 
 
 
610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
612 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.51 
 
 
610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 
605 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 
620 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 
563 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  30.18 
 
 
6768 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
576 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 
602 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  32.57 
 
 
4575 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 
605 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 
598 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
887 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  28.8 
 
 
624 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
603 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 
605 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
591 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.47 
 
 
603 aa  123  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.82 
 
 
1537 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
1538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
603 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 
555 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 
610 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.15 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.17 
 
 
610 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.62 
 
 
602 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
1538 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 
564 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 
819 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.28 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
604 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  27.07 
 
 
555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.75 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  28.48 
 
 
555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 
604 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 
609 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 
601 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
525 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
602 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.79 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  30.15 
 
 
824 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 
854 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.44 
 
 
510 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 
603 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
824 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 
610 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.02 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
604 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.7 
 
 
492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  25.69 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
2376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 
918 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 
605 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.19 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
825 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
5154 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>