More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2430 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
483 aa  952    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  66.94 
 
 
484 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  45.11 
 
 
489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 
489 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  46.82 
 
 
481 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  44.73 
 
 
487 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  47.32 
 
 
486 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 
506 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.88 
 
 
743 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 
487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  45.4 
 
 
495 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 
475 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38 
 
 
507 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 
493 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
730 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.37 
 
 
519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 
498 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
478 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  39.53 
 
 
504 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
492 aa  226  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
507 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 
591 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.64 
 
 
580 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
580 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.52 
 
 
607 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
504 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 
603 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 
633 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 
493 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
509 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
620 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.95 
 
 
610 aa  143  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 
603 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 
605 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.19 
 
 
612 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.94 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 
824 aa  140  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
520 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 
812 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
603 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 
592 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 
597 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
615 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  31.05 
 
 
811 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.52 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
598 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 
612 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
605 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 
601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.64 
 
 
606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  25.44 
 
 
622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  25.71 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.14 
 
 
610 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
508 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.67 
 
 
603 aa  133  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.83 
 
 
563 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 
610 aa  133  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  28.34 
 
 
824 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
605 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 
597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 
602 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 
595 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.76 
 
 
937 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 
606 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.12 
 
 
612 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 
607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  28.33 
 
 
824 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  26.29 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  26.29 
 
 
496 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
603 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.83 
 
 
599 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  26.07 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  26.07 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.8 
 
 
599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.11 
 
 
600 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 
605 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
503 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 
601 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 
604 aa  126  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
600 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  29.95 
 
 
624 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
597 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
487 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 
514 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.9 
 
 
563 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
615 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
608 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 
605 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 
610 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 
596 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
653 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 
609 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>