More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1936 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
506 aa  993    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  63.77 
 
 
486 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  51.64 
 
 
493 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  50.32 
 
 
489 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  49.39 
 
 
487 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  50.32 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  54.25 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  47.43 
 
 
487 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 
498 aa  339  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  44.83 
 
 
475 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  50.54 
 
 
495 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 
730 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 
483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.76 
 
 
743 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.35 
 
 
519 aa  306  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.76 
 
 
504 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.72 
 
 
507 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 
484 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 
478 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
507 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
546 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
493 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.03 
 
 
580 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
580 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
609 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  31.76 
 
 
811 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 
610 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.8 
 
 
607 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 
603 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
606 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.36 
 
 
610 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 
603 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 
509 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.95 
 
 
610 aa  136  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 
603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 
595 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
607 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 
504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.84 
 
 
602 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
597 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 
604 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
612 aa  133  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 
824 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 
604 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 
633 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  22.31 
 
 
610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 
593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  28.41 
 
 
600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
591 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
597 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  23.63 
 
 
547 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
1538 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
615 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
499 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
1538 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
616 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 
812 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.34 
 
 
599 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
596 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
605 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.97 
 
 
563 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
624 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
599 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.06 
 
 
1537 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
605 aa  123  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
490 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
601 aa  123  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 
602 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 
630 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
633 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
602 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.45 
 
 
937 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.15 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.48 
 
 
563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  26.68 
 
 
558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
622 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  23.66 
 
 
598 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
601 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.54 
 
 
587 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  24.56 
 
 
618 aa  119  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
613 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  24.72 
 
 
603 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  25.1 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
619 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
608 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 
602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 
585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.46 
 
 
563 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.79 
 
 
598 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
612 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.47 
 
 
612 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
600 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>