More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2668 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  100 
 
 
495 aa  964    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  50.11 
 
 
486 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 
506 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  45.72 
 
 
481 aa  336  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 
483 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 
475 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  43.29 
 
 
489 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 
487 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 
493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  43.2 
 
 
489 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
730 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.64 
 
 
507 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.78 
 
 
743 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.66 
 
 
519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
484 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
478 aa  256  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.4 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
507 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
597 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
597 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 
615 aa  133  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 
591 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 
937 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
493 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.87 
 
 
580 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 
612 aa  127  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 
603 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
595 aa  127  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
600 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.17 
 
 
598 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 
633 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.01 
 
 
599 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
603 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
593 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
607 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
601 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
596 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
612 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  26.9 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 
607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
604 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
599 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 
599 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 
824 aa  120  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
597 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 
605 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 
594 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 
604 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.85 
 
 
602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.36 
 
 
614 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.65 
 
 
612 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 
615 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.11 
 
 
610 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  33.87 
 
 
811 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  23.37 
 
 
610 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 
602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.04 
 
 
610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
620 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 
607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  22.42 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
606 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
599 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
887 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.26 
 
 
603 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
622 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 
604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  21.5 
 
 
609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 
602 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
609 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
576 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.25 
 
 
611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
599 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  33.47 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40.62 
 
 
606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.12 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  28.03 
 
 
824 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.25 
 
 
606 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
605 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.77 
 
 
599 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  35.2 
 
 
677 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>