More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0291 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 730 aa  1489    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.18 
 
 		 743 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  45.38 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  45.17 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 487 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 		 487 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.92 
 
 		 519 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  44.69 
 
 		 486 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 475 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.55 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 493 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  45.05 
 
 		 481 aa  326  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  42.58 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  42.83 
 
 		 495 aa  300  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  41.78 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 484 aa  297  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 498 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  60.35 
 
 		 226 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  60.35 
 
 		 226 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  59.73 
 
 		 226 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  59.73 
 
 		 226 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  58.06 
 
 		 217 aa  269  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  56.39 
 
 		 224 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  56.81 
 
 		 216 aa  264  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 483 aa  264  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  60.37 
 
 		 217 aa  263  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  56.48 
 
 		 227 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  55.87 
 
 		 223 aa  250  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  56.76 
 
 		 223 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  54.46 
 
 		 221 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  56.28 
 
 		 236 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  54.98 
 
 		 218 aa  234  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  53.7 
 
 		 231 aa  231  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  52.58 
 
 		 229 aa  217  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 492 aa  210  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  48.58 
 
 		 220 aa  210  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  48.61 
 
 		 223 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 507 aa  184  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  44.19 
 
 		 222 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  43.38 
 
 		 226 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  40.65 
 
 		 202 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 493 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  26.09 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 546 aa  152  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 596 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.47 
 
 		 610 aa  140  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 825 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 547 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 555 aa  138  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 825 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 609 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 547 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  29.21 
 
 		 811 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  23.51 
 
 		 607 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 633 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 612 aa  134  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  27.05 
 
 		 824 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  23.21 
 
 		 610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 605 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 597 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 610 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 1538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.63 
 
 		 1537 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.44 
 
 		 612 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 492 aa  130  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 1538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.54 
 
 		 580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 580 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 		 605 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  29.5 
 
 		 624 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.61 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3272  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.59 
 
 		 607 aa  127  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 572 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  27.65 
 
 		 824 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 660 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 599 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 		 555 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 598 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 620 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.42 
 
 		 514 aa  125  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 620 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27 
 
 		 612 aa  125  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 623 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 551 aa  124  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.65 
 
 		 563 aa  123  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  21.62 
 
 		 824 aa  123  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 1557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  23.06 
 
 		 812 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.67 
 
 		 592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>