More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003613 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 519 aa  1057    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.35 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 		 743 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 475 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 730 aa  332  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  42.49 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  40.22 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 		 478 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 		 487 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  39.84 
 
 		 489 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 487 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  40.99 
 
 		 481 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  39.61 
 
 		 504 aa  263  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  39.36 
 
 		 495 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 507 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 824 aa  156  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 600 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 		 546 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 605 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 620 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.91 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 602 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.41 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 609 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.65 
 
 		 563 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.62 
 
 		 598 aa  143  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 596 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.89 
 
 		 603 aa  140  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 610 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 607 aa  140  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 591 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 599 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 616 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  26.93 
 
 		 558 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  25.78 
 
 		 547 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 615 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 602 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.02 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  27.63 
 
 		 811 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26 
 
 		 599 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.45 
 
 		 611 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  25.96 
 
 		 610 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.22 
 
 		 563 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 612 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 603 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.69 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.71 
 
 		 612 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 		 606 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 608 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 607 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 597 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 622 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 		 812 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 595 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 604 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 633 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  27.56 
 
 		 679 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 605 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24.04 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 576 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 601 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 594 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.72 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  27.18 
 
 		 607 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.87 
 
 		 491 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  29.09 
 
 		 624 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 606 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 487 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 620 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  27.8 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  25.39 
 
 		 599 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 		 599 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 600 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  25.4 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>