More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3829 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3829  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 498 aa  1019    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03393  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  53.03 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1936  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  41.53 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  40.38 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3043  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 489 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0600729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  41.06 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3023  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3943  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 475 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3350  AMP-dependent synthetase and ligase  40.76 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0135  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.47 
 
 		 507 aa  297  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.395126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3313  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 		 487 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.089081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003613  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 743 aa  279  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2430  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119218  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2668  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  37.89 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 478 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2587  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4517  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 493 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1286  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.512902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  25.54 
 
 		 580 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  25.92 
 
 		 605 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 601 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 645 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.29 
 
 		 614 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  25.19 
 
 		 602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  23.59 
 
 		 633 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 652 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  25.16 
 
 		 824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 612 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  23.42 
 
 		 609 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  27.4 
 
 		 824 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 633 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.82 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.54 
 
 		 602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.38 
 
 		 607 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.92 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  23.76 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 612 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.78 
 
 		 599 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  23.34 
 
 		 598 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 609 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  29.01 
 
 		 811 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.61 
 
 		 610 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  30.29 
 
 		 624 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 620 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 609 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  23.77 
 
 		 591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 622 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 887 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.34 
 
 		 610 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 594 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  24.18 
 
 		 824 aa  109  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  22.43 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.34 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  22.98 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 608 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 599 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  22.07 
 
 		 610 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  23.16 
 
 		 612 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 825 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 825 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  24.08 
 
 		 599 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.73 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  24.49 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  23.29 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  21.58 
 
 		 660 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.06 
 
 		 612 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 567 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  22.85 
 
 		 604 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.27 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  21.38 
 
 		 669 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 903 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  23.31 
 
 		 685 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  20.99 
 
 		 610 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 647 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 605 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  25.95 
 
 		 1470 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>