More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6820 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 653 aa  1303    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  39.87 
 
 		 607 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 613 aa  323  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 		 612 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 626 aa  318  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 601 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 612 aa  310  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 607 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 616 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 618 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 773 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  33.23 
 
 		 606 aa  294  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 624 aa  290  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 623 aa  288  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 600 aa  286  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 602 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 597 aa  277  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 597 aa  277  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  31.88 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 		 599 aa  272  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 601 aa  271  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.88 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 602 aa  267  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 604 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 604 aa  265  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 610 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 597 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 615 aa  262  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 601 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 		 606 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 611 aa  258  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.99 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 607 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 599 aa  257  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 606 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 606 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  28.71 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 597 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 591 aa  253  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 615 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 607 aa  252  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 611 aa  251  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  30.66 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 599 aa  251  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 609 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 593 aa  250  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 608 aa  250  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 622 aa  250  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 603 aa  250  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 617 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 601 aa  246  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  37.06 
 
 		 571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 607 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 603 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.63 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 603 aa  243  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 607 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 655 aa  242  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 661 aa  242  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 592 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 605 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 602 aa  240  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 599 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 658 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 644 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 653 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 612 aa  237  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 682 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 599 aa  237  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 609 aa  237  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 603 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 610 aa  236  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 645 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 602 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>