More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11582 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  100 
 
 		 571 aa  1152    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  51.56 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  49.43 
 
 		 773 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 		 613 aa  364  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  43.61 
 
 		 616 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 612 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  42.82 
 
 		 608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40.51 
 
 		 612 aa  309  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 623 aa  293  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 594 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 618 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 		 607 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 606 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 626 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 607 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 649 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 607 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 610 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 596 aa  267  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.28 
 
 		 610 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 		 616 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 615 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 610 aa  263  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 604 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 610 aa  260  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 611 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 617 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 602 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 599 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 597 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 605 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 597 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 597 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 615 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.57 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 607 aa  250  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 597 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 590 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 609 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 597 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 633 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 603 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 606 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  36.36 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 653 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 604 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 592 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.11 
 
 		 599 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 		 592 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 603 aa  243  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  37.56 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.02 
 
 		 612 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  34.35 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 622 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 600 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 600 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 613 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 598 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 597 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 597 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 598 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  34.58 
 
 		 568 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.51 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 620 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.75 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 606 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  34.64 
 
 		 602 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>