217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3323 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3323  NLP/P60 protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000142294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  33.64 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  43.24 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  34 
 
 		 556 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 150 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 177 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 859 aa  52.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 177 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 536 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.74 
 
 		 177 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  34.38 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  37.17 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35.71 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  38.46 
 
 		 170 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  30.25 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 179 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 532 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  30.39 
 
 		 446 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.03 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 532 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40.26 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  39.19 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.83 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  30.28 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  36 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  36.49 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  34.09 
 
 		 181 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  35.05 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  34.48 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.65 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 418 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  27.81 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  29.51 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  34.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.8 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  34.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  34.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  34.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  34.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  38.37 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0756  NLP/P60 protein  30.23 
 
 		 398 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.640011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  37.97 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  34.09 
 
 		 181 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 173 aa  47  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  35.14 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 476 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  38.89 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  34.48 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 369 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  31.93 
 
 		 148 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  35.87 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1467  putative enterotoxin  40.38 
 
 		 947 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  32.22 
 
 		 171 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  37.65 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  35.37 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.48 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1266  putative enterotoxin  40.38 
 
 		 956 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  26.52 
 
 		 549 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  26.87 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  29.66 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  34 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>