54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1266 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1467  putative enterotoxin  92.81 
 
 
947 aa  1699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1266  putative enterotoxin  100 
 
 
956 aa  1935    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  25.64 
 
 
1049 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  24.42 
 
 
969 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  23.21 
 
 
582 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  22.64 
 
 
575 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.74 
 
 
553 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  22.44 
 
 
582 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
1776 aa  83.2  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  22.49 
 
 
579 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.49 
 
 
580 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  22.49 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  22.75 
 
 
577 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  23.03 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  22.31 
 
 
578 aa  79  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.43 
 
 
860 aa  77  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  23.51 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  23.51 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  20.63 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  23.02 
 
 
564 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  20.22 
 
 
564 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  22.98 
 
 
603 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  22.98 
 
 
603 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.33 
 
 
434 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  33.33 
 
 
430 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  25.88 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  25.88 
 
 
384 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.88 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  25.88 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.88 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  25.88 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  25.49 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  26.97 
 
 
341 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  24.8 
 
 
384 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  25.1 
 
 
384 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  25.11 
 
 
418 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.66 
 
 
616 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  28.29 
 
 
386 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  19.76 
 
 
1284 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  23.47 
 
 
383 aa  57.4  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  20.85 
 
 
430 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  26.7 
 
 
370 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  20.31 
 
 
420 aa  52  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  20.31 
 
 
420 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  21.62 
 
 
413 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  21.62 
 
 
432 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  20.31 
 
 
426 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  20.31 
 
 
420 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  20.61 
 
 
426 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  20.31 
 
 
420 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  20.31 
 
 
420 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  21.13 
 
 
549 aa  48.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3323  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
277 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000142294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  21.65 
 
 
553 aa  45.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>