More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0756 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0756  NLP/P60 protein  100 
 
 		 398 aa  806    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.640011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  28.61 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  29.12 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  29.9 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  27.85 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  28.28 
 
 		 413 aa  99.4  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  25.26 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  43.31 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  43.31 
 
 		 485 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  44.44 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  26.5 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  36.59 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  34.15 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  21.6 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  34.29 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.66 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.8 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  34.45 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  34.45 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  34.45 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.42 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  30.46 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  30.38 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  30.38 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  34.44 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  34.44 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  30.38 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.76 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  34.44 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  30.38 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.23 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  30.38 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  27.27 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  27.27 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  34.9 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  34.44 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  34.44 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  34.44 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  34.44 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  37.89 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  40 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  37.36 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  24.62 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  35.62 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 283 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  36.94 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.8 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  32.4 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.86 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  36.07 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  38.89 
 
 		 181 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  37.25 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  37 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  37 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>