61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1467 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1467  putative enterotoxin  100 
 
 
947 aa  1924    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1266  putative enterotoxin  92.81 
 
 
956 aa  1665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  27.05 
 
 
1049 aa  155  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  24.8 
 
 
969 aa  144  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.71 
 
 
553 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  22.56 
 
 
582 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  21.95 
 
 
564 aa  85.9  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  21.95 
 
 
564 aa  85.9  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  22.32 
 
 
564 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  21.81 
 
 
582 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  21.87 
 
 
564 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  22.17 
 
 
564 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 
1776 aa  80.9  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  22.22 
 
 
579 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.35 
 
 
860 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  22.22 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  22.02 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  21.4 
 
 
577 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  21.85 
 
 
578 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  26.28 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  25.97 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.33 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  33.33 
 
 
430 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.97 
 
 
386 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  26.59 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  25.64 
 
 
384 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.97 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  25.97 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  26.59 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  26.25 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  28.19 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  26.29 
 
 
383 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  24 
 
 
418 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  28.24 
 
 
386 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  22.63 
 
 
603 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  22.63 
 
 
603 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.87 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.45 
 
 
413 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.16 
 
 
1284 aa  58.9  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  23.45 
 
 
420 aa  58.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.45 
 
 
420 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.45 
 
 
426 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  23.45 
 
 
420 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  23.01 
 
 
426 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  23.45 
 
 
420 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  23.45 
 
 
420 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  21.58 
 
 
430 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  26.42 
 
 
370 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 
616 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  18.04 
 
 
751 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 
474 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  23.91 
 
 
773 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  19.82 
 
 
549 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  21.97 
 
 
536 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.37 
 
 
448 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  23.73 
 
 
430 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  22.12 
 
 
553 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3323  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
277 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000142294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
319 aa  45.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>