191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3221 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3221  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.282272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  40 
 
 		 581 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.28 
 
 		 674 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  37.28 
 
 		 547 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  30.88 
 
 		 635 aa  92.8  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  30.22 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  29.48 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  33.75 
 
 		 606 aa  83.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  34.31 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  34.43 
 
 		 670 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  36.36 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  34.82 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  29.34 
 
 		 496 aa  72.4  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  33.95 
 
 		 607 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  31.11 
 
 		 505 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  46.51 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  34.96 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  28.72 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  37.62 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.93 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.62 
 
 		 977 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.34 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  28.93 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  27.89 
 
 		 471 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  32.08 
 
 		 640 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  26.52 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.22 
 
 		 853 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  38.32 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.25 
 
 		 849 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  31.32 
 
 		 532 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.08 
 
 		 855 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  29.03 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  30.6 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.45 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  28.41 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  29.74 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  34.09 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  43.62 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  33.11 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  30.92 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  31.02 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.41 
 
 		 844 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  29.28 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.64 
 
 		 845 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  30.77 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.64 
 
 		 844 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  30.72 
 
 		 714 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.51 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.66 
 
 		 844 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  27.52 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  30.05 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  28.67 
 
 		 1029 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.55 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.81 
 
 		 1055 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  29.25 
 
 		 496 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  31.09 
 
 		 531 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.89 
 
 		 856 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  30.48 
 
 		 533 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 		 607 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  24.6 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  41.86 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.37 
 
 		 594 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  29.11 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  28.38 
 
 		 740 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.37 
 
 		 990 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  40.7 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.53 
 
 		 981 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  31.25 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  43.02 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  30.71 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.7 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  30.71 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  30.71 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  27.14 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  36.11 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  33.03 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  32.08 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  36.17 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 		 995 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  32.71 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  29.28 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.64 
 
 		 595 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  35.51 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  35.64 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  31.78 
 
 		 638 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  26.42 
 
 		 530 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.7 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.86 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>