251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4074 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4074  putative permease  100 
 
 		 366 aa  732    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  43.26 
 
 		 433 aa  322  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  43.86 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  48.51 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  52.56 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  39.5 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  38.87 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  33.58 
 
 		 451 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  40.84 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  37.57 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  40.96 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  39.11 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  39.8 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  39.49 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  41.78 
 
 		 355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  37.29 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  33.57 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  39.87 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  34.66 
 
 		 357 aa  205  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  45.33 
 
 		 510 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  47.96 
 
 		 461 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  50 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  42.38 
 
 		 491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  43.07 
 
 		 495 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  37.45 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  41.83 
 
 		 496 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  41.55 
 
 		 497 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  41.55 
 
 		 509 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  42.27 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  42.13 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  43.61 
 
 		 474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  40.99 
 
 		 511 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  41.12 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  31.52 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  34.74 
 
 		 620 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  28.18 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  26.84 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  27.15 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  26.16 
 
 		 714 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  26.75 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  22.84 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  24.54 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  23.29 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  22.39 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  22.89 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.33 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.74 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  24.12 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.81 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  21.98 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.32 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  25.26 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.43 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.71 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.26 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  24.67 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  25.53 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  26.2 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.08 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  22.85 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  20.49 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.92 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  23.75 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  24.03 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  24.75 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  26.04 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.26 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.62 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  26.69 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  28.62 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  23.17 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  24.29 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  23.17 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  24.04 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  22.92 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  22.34 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  23.02 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  23.85 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.47 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  23.81 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  23.88 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  25.24 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  27.16 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  23.13 
 
 		 633 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  25.41 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  22.88 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  22.88 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  23.24 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  24.35 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  29.84 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.21 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  23.88 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  25.62 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  21.53 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  28.06 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  24.56 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  24.03 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.95 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  20.4 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.86 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>