272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3941 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3941  permease  100 
 
 		 363 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  43.36 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  32.55 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  27.83 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  31.7 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  28.9 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  28.76 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  28.71 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  29.81 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  30.22 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  28.47 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  29.74 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  30.63 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  28.15 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  29.93 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  28.49 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.91 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  30.36 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  29.14 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  27.47 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  29.93 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  26.87 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  28.78 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  27.84 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  28.04 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  28.73 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  27.7 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  26.77 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  29.69 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  26.09 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  27.36 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  25.07 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  27.48 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  28.73 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  28.47 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  26.81 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  25.98 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  27.74 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  28.22 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  27.68 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  27.68 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  28.83 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.4 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  27.56 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  27.64 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.87 
 
 		 620 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  26.28 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  28.71 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  28.43 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  27.01 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  26.87 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  27.3 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  30.99 
 
 		 475 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  27.01 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  26.9 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  24.83 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  27.57 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  26.37 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  26.76 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  26.09 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  26.33 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.79 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.55 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  27.21 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  27.64 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  26.35 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  28.57 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  27.84 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  27.08 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  28.21 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  28.99 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  27.74 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  26.53 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  26.74 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  27.94 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  26.74 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  29.82 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  26.5 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  25.85 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  25.09 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  27.34 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  29.92 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  27.15 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  26.18 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  24.76 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  26.37 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  27.8 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  26.28 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  25.72 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  26.69 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  25 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  28 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  24.82 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  27.95 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  24.29 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  27.54 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  29.96 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  25.08 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>