254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1783 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1783  permease  100 
 
 		 362 aa  715    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  67.87 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  63.22 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  70 
 
 		 330 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  66.2 
 
 		 353 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  62.6 
 
 		 381 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  63.87 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  64.52 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  65.44 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  66.76 
 
 		 352 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  61.93 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  65.48 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  68.11 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  62.18 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  63.3 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  66.87 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  59.27 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  62.75 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  66.36 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  62.69 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  64.52 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  57.97 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  64.71 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  65.49 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  63.01 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  59.51 
 
 		 353 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  61.69 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  57.61 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  63.49 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  66.22 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  66.67 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  57.69 
 
 		 315 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  59.24 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  56.41 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  58.6 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  56.55 
 
 		 317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  55.45 
 
 		 315 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  55.28 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  50.64 
 
 		 323 aa  338  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  51.44 
 
 		 319 aa  335  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  55.13 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  50.8 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  52.58 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  47.62 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  46.47 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  48.43 
 
 		 323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.46 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  49.03 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  46.92 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  49.19 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  48.1 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  45.4 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  43.2 
 
 		 335 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  48.51 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  42.94 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  42.94 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  42.28 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  45.12 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  47.44 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  44.79 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  43.08 
 
 		 331 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  43.08 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  42.77 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  43.08 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  42.55 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  45.6 
 
 		 370 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  43.08 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  46.79 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  43.08 
 
 		 331 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  42.02 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  45.69 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  40.92 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  42.21 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  42.77 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  42.28 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  47.37 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  43.3 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  41.9 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  43.23 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  46.84 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  40.44 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  46.71 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  43.71 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  45.88 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  40.91 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  36.63 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  40.19 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.11 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  37.03 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  30.87 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  29.68 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  30.63 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  29.75 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  29.21 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  32.57 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  32.25 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  28.41 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  31.35 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  29.01 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  28.41 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>