225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0526 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0526  permease  100 
 
 		 350 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  56.94 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  50.44 
 
 		 362 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  45.19 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  38.05 
 
 		 423 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  41.27 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  41 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  42.67 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  43.09 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  41.29 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  40.99 
 
 		 391 aa  212  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  40.89 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  43.64 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  39.69 
 
 		 406 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  37.76 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  38.67 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  47.56 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  51.68 
 
 		 433 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  53.24 
 
 		 474 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  50.33 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36.27 
 
 		 620 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  50.33 
 
 		 503 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  28.78 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  47.5 
 
 		 495 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  49.03 
 
 		 500 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  50.65 
 
 		 510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  48.19 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  49.67 
 
 		 511 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  50.67 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  49.67 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  52.9 
 
 		 496 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  52.9 
 
 		 501 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  52.9 
 
 		 497 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26.58 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  43.09 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  43.07 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  29.33 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  29.55 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  29.14 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  25.43 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  27.95 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  27.4 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  26.42 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  26.76 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  28.05 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.17 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  27.04 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  28.21 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  24.9 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  27.41 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  26.52 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  26.97 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25.75 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25.75 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  23.1 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.48 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  26.18 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.98 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  25.54 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  25.09 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  25.57 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  27.08 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  28.77 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  26.67 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  27.48 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  26.64 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  29.73 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  28.36 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  25.67 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0299  permease  19.06 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  25.19 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  25 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  25.09 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  25.81 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  28.87 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  28.47 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  27.78 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  25.24 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  24.44 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  22.88 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.19 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.46 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  24.64 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  21.33 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  21.55 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  20 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  22.63 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  26.59 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  24.52 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  25 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  24.52 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  24.52 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.47 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  34.45 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  28.73 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  27.8 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  25.09 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  29.1 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>