254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1117 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1117  permease  100 
 
 		 352 aa  698    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  74.93 
 
 		 356 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  70.37 
 
 		 353 aa  494  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  72.19 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  72.9 
 
 		 350 aa  474  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  68.9 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  73.25 
 
 		 344 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  62.28 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  61.19 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  57.39 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  55.65 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  62.65 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  56.94 
 
 		 351 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  59.72 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  58.77 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  56.52 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  55.59 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  56.92 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  60.33 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  54.57 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  55.59 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  58.15 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  57.35 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  60.26 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  58.26 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  56.13 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  57.61 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  57.26 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  60.26 
 
 		 366 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  59.93 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  58.13 
 
 		 349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  53.33 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  52.81 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  50.94 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  52.7 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  53.33 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  51.31 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  50.94 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  49.51 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  49.03 
 
 		 323 aa  305  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  47.97 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  50.66 
 
 		 322 aa  302  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  47.54 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  46.57 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  47.71 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  52.44 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  46.41 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  43.34 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  44.3 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  44.14 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.75 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  42.09 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  40.92 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  45.72 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  46.08 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  45.72 
 
 		 331 aa  269  7e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  47.19 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  46.56 
 
 		 318 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  47.06 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  39.16 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  39.16 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  39.55 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  45.7 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  36.92 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  39.35 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  38.71 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  39.23 
 
 		 331 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  40.51 
 
 		 331 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  40.19 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.24 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  39.75 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  37.27 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  37.27 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  38.68 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  42.9 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  45.07 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.66 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  46.08 
 
 		 337 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  41.61 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  45.07 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  43.14 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  42.28 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  36.89 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  36.09 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  35.44 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  31.96 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.15 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  33.44 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.67 
 
 		 301 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  32.38 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  33.64 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  32.91 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  32.59 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  32.59 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  32.78 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  29.33 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  29.91 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  29.8 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  29.02 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>