258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0132 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0132  permease  100 
 
 		 363 aa  713    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  86.63 
 
 		 367 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  62.71 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  63.96 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  51.04 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  52.17 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  51.06 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  47.32 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  35.85 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  41.1 
 
 		 365 aa  236  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  33.81 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  34.1 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  36.51 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  56.4 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  40.97 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  39.49 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  41.29 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  37.77 
 
 		 620 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  34.8 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  50.36 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  45.45 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  42.13 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  31.7 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  55.17 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  44.63 
 
 		 511 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  44.63 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  45.12 
 
 		 496 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  47.77 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  29.28 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  46.58 
 
 		 495 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  43.79 
 
 		 501 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  45.34 
 
 		 491 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  39.9 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  47.37 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  45.91 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  50.78 
 
 		 497 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  27.18 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  25.88 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  28.14 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  27.81 
 
 		 714 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  26.56 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  26.53 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  25.87 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.95 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  26.05 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  25.9 
 
 		 316 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  25.71 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  28.4 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  26.24 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  27.8 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.01 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.46 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.41 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  25.59 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  24.4 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  23.46 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.12 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.62 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.15 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  25.87 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  22.15 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.97 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  21.96 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  23.46 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.73 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  23.89 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  23.13 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0299  permease  21.94 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  22.26 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  23.26 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  22.75 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.24 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  22.75 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.24 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  24.83 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  19.18 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  19.45 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  21.48 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  23.72 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  20 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  23.18 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  24.58 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  25.45 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  20.87 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  24.83 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.91 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  22.52 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  24.8 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  24.81 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  24.34 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.65 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  23.79 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>