222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0014 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0014  permease  100 
 
 		 451 aa  879    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  51.44 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  42.25 
 
 		 356 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  37.63 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  37.9 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  37.84 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  36.36 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  36.81 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  36.09 
 
 		 474 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  36.46 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  36.29 
 
 		 501 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  36.69 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  39.55 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  36.33 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  35.56 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  35.21 
 
 		 513 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  35.76 
 
 		 497 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  35.88 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  35.28 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  36.13 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  35.22 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  35.18 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  54.26 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  65.25 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  61.38 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  33.58 
 
 		 366 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  52.06 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  55.43 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  47.5 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  52.08 
 
 		 509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  46.76 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  41.44 
 
 		 350 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  45.04 
 
 		 620 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  42.98 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25.93 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  32.56 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  32 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26.35 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.65 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  20.83 
 
 		 350 aa  67  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  29.74 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  33.56 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  20.36 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  31.3 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  20.36 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  28.68 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  33.74 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  32.73 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.98 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.98 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  24.83 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  33.33 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  22.71 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.14 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  30.99 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  23.02 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  20.59 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.16 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  23.2 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  21.35 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  31.88 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  32.09 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  23.47 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  35.71 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  31.93 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  32.74 
 
 		 714 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  25.55 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  25 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  29.1 
 
 		 633 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  32.11 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  27.27 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  29.51 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  26.61 
 
 		 345 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  27.91 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  26.95 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  24.39 
 
 		 294 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  27.48 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  29.69 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  25.55 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  32.73 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  25.63 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.17 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  33.03 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  26.61 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  26.61 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  26.8 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  28.93 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  27.88 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  28.9 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  23.78 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>