270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6834 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6834  permease  100 
 
 		 620 aa  1176    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  34.41 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  37.77 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  35.17 
 
 		 352 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  36.79 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  34.81 
 
 		 357 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  36.18 
 
 		 356 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  28.89 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  38.64 
 
 		 714 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  34.32 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  33.24 
 
 		 358 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  31.32 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  35.62 
 
 		 378 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  28.28 
 
 		 504 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  31.89 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  34.95 
 
 		 509 aa  132  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  37.39 
 
 		 537 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  40 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  38.7 
 
 		 552 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  34.47 
 
 		 362 aa  128  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  38.7 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  35.95 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  38.26 
 
 		 552 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  38.26 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  38.26 
 
 		 559 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  35.49 
 
 		 542 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  38.26 
 
 		 561 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  38.26 
 
 		 552 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  36.94 
 
 		 553 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  32.1 
 
 		 391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  40 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  34.74 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  45.04 
 
 		 451 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  33.17 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  34.27 
 
 		 491 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  29.87 
 
 		 363 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  32.56 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  33.18 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  34.9 
 
 		 474 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  32.56 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  32.72 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  32.72 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  32.56 
 
 		 513 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  33.51 
 
 		 423 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  32.56 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  34.26 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  33.12 
 
 		 355 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  33.01 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  31.23 
 
 		 301 aa  98.2  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  34 
 
 		 509 aa  97.1  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  33.51 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.08 
 
 		 293 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  31.02 
 
 		 318 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  35.71 
 
 		 510 aa  94  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  27.74 
 
 		 308 aa  94  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  29.82 
 
 		 348 aa  92  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  30.07 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.89 
 
 		 294 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  30.08 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  30.16 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  27.04 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  29.53 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  28.52 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  28.93 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  29.01 
 
 		 331 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  29.83 
 
 		 370 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  29.69 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  29.26 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  28.91 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  26.67 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  30.59 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  33.81 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  31.56 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  23.83 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  28.88 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  24.18 
 
 		 315 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  30.43 
 
 		 332 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  28.85 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  28.85 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  30.43 
 
 		 332 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  26.98 
 
 		 350 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  28.94 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  28.24 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25.55 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.42 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  27.24 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  26.55 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  24.84 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  31.15 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  26.09 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  24.47 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  26.79 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  28.62 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  25.16 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  23.84 
 
 		 325 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  28.95 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  29.09 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  26.91 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>