18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3628 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1039    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  65.45 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  65.92 
 
 		 552 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  65.92 
 
 		 552 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  62.11 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  63.53 
 
 		 509 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  58.86 
 
 		 542 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  65.45 
 
 		 561 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  65.11 
 
 		 552 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  65.11 
 
 		 551 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  64.65 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  64.91 
 
 		 547 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  60.12 
 
 		 550 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  64.37 
 
 		 540 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  59.49 
 
 		 537 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  60.47 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  47.54 
 
 		 714 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  37.78 
 
 		 620 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>