104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3634 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3634  permease  100 
 
 		 714 aa  1431    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  47.54 
 
 		 535 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  44.8 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  49.34 
 
 		 540 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  46.72 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  46.31 
 
 		 552 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  46.31 
 
 		 552 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  44.29 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  47.6 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  43.72 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  43.72 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  43.72 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  43.32 
 
 		 561 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  45.21 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  46.98 
 
 		 515 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  44.75 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  32.68 
 
 		 620 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  43.82 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.39 
 
 		 402 aa  111  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  28.11 
 
 		 363 aa  101  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  27.16 
 
 		 356 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  27.57 
 
 		 357 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  30.86 
 
 		 350 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  27.96 
 
 		 367 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  29.73 
 
 		 358 aa  87  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  28.63 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  26.15 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  26.01 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  27.45 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  33.58 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  23.65 
 
 		 391 aa  70.5  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  32.12 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  25.86 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  32.84 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  28.26 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  31.72 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  24.08 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  33.07 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  30.77 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  30.77 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  30 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  33.56 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  30.77 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  34.11 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.39 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  34.33 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  33.58 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  33.58 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  33.58 
 
 		 497 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  32.35 
 
 		 451 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  23.84 
 
 		 345 aa  54.7  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  33.33 
 
 		 510 aa  54.3  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  22.45 
 
 		 352 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.9 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  23.57 
 
 		 330 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  25.82 
 
 		 353 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  24.32 
 
 		 330 aa  52  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.52 
 
 		 331 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  21.17 
 
 		 367 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  21.67 
 
 		 348 aa  51.2  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  22.22 
 
 		 312 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  26 
 
 		 381 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  32.2 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  24.71 
 
 		 331 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  25.57 
 
 		 331 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  24.76 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  25.29 
 
 		 366 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  24.76 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  25.29 
 
 		 366 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  23.75 
 
 		 350 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  24.14 
 
 		 331 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  24.76 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  31.33 
 
 		 255 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.72 
 
 		 302 aa  48.9  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  26.01 
 
 		 331 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  21.71 
 
 		 324 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  26.01 
 
 		 331 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  24.44 
 
 		 346 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.64 
 
 		 363 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  23 
 
 		 319 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  24.44 
 
 		 346 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  24.44 
 
 		 346 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  23.88 
 
 		 524 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  25.78 
 
 		 345 aa  47.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  24.44 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.36 
 
 		 318 aa  47.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  27.43 
 
 		 331 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  24.02 
 
 		 364 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  21.9 
 
 		 354 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  22.35 
 
 		 354 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  25.08 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  23.89 
 
 		 335 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.59 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  22.64 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  22.95 
 
 		 319 aa  45.8  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  23.39 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  25.5 
 
 		 373 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  23.66 
 
 		 377 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>