20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0117 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  83.54 
 
 		 551 aa  827    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  84.6 
 
 		 552 aa  827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  73.2 
 
 		 515 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  84.63 
 
 		 561 aa  829    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  69.23 
 
 		 550 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  73.48 
 
 		 509 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  84.42 
 
 		 559 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  77.36 
 
 		 537 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  89.67 
 
 		 547 aa  858    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  69.01 
 
 		 542 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1081    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  98.55 
 
 		 552 aa  1067    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  67.53 
 
 		 553 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  82.35 
 
 		 504 aa  789    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  71.4 
 
 		 540 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  65.92 
 
 		 535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  46.31 
 
 		 714 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.71 
 
 		 620 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  47.83 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.23 
 
 		 402 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>