19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3747 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  65.11 
 
 		 553 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  67.68 
 
 		 552 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  77.2 
 
 		 515 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  67.93 
 
 		 561 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  70.63 
 
 		 550 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  77.67 
 
 		 509 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  67.81 
 
 		 559 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1056    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  67.81 
 
 		 551 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  73.09 
 
 		 547 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  68.18 
 
 		 542 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  70.15 
 
 		 552 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  70.34 
 
 		 552 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  65.49 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  63.38 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  65.52 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  47.18 
 
 		 714 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.63 
 
 		 620 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  48.72 
 
 		 205 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>