19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4829 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  72.89 
 
 
551 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  73.09 
 
 
552 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1010    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  68.25 
 
 
561 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  71.75 
 
 
550 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  82.71 
 
 
509 aa  749    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  73.09 
 
 
559 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  76.12 
 
 
540 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  73.69 
 
 
547 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  67.05 
 
 
542 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  70.17 
 
 
552 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  70.36 
 
 
552 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  66.73 
 
 
553 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  69.96 
 
 
537 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  67.44 
 
 
504 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  65.45 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  45.23 
 
 
714 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36.3 
 
 
620 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.52 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>